È nato nel 1950 a Orani, dove vive e lavora come insegnante. Scrive il suo primo romanzo, Collodoro, nel 1997, edito dalla casa editrice nuorese Solinas. Nel 1999 inizia il sodalizio con Il Maestrale, con la quale ha pubblicato i successivi romanzi: Il viaggio degli inganni, Il postino di Piracherfa (2000), che nel 2004 è stato tradotto in Francia, Cristolu (2001), La sesta ora (2003). I romanzi La leggenda di Redenta Tiria e La vedova scalza hanno trovato una nuova importante collocazione presso la casa editrice Adelphi di Milano. Con questo suo ultimo lavoro, Niffoi si è aggiudicato il Premio Campiello per la narrativa. Il suo ultimo libro pubblicato da Adelphi è Collodoro